Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cyp2d40Q6P8N9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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