Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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