Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RbfaQ6P3B9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RbfaQ6P3B9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RbfaQ6P3B9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RbfaQ6P3B9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RbfaQ6P3B9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RbfaQ6P3B9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RbfaQ6P3B9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RbfaQ6P3B9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RbfaQ6P3B9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RbfaQ6P3B9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RbfaQ6P3B9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RbfaQ6P3B9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RbfaQ6P3B9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms