Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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NipblQ6KCD5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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NipblQ6KCD5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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NipblQ6KCD5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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