Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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