Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ParpbpQ6IRT3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ParpbpQ6IRT3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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