Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11bQ6DFW5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11bQ6DFW5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms