Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms