Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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