Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rftn1Q6A0D4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms