Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

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Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sbno1Q689Z5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sbno1Q689Z5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Sbno1Q689Z5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sbno1Q689Z5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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