Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Surf4Q64310 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms