Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms