Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PatjQ63ZW7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms