Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms