Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms