Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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