Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms