Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrhQ62361 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrhQ62361 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms