Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ss18Q62280 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ss18Q62280 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ss18Q62280 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ss18Q62280 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ss18Q62280 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Ss18Q62280 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ss18Q62280 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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