Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms