Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SnrpaQ62189 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SnrpaQ62189 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SnrpaQ62189 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SnrpaQ62189 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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