Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf1Q61999 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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