Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin1Q61644 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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