Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MslnQ61468 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MslnQ61468 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms