Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms