Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamb3Q61087 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms