Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usf1Q61069 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usf1Q61069 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usf1Q61069 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usf1Q61069 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usf1Q61069 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usf1Q61069 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usf1Q61069 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms