Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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DbpQ60925 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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DbpQ60925 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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DbpQ60925 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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DbpQ60925 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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DbpQ60925 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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DbpQ60925 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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DbpQ60925 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DbpQ60925 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DbpQ60925 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DbpQ60925 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DbpQ60925 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DbpQ60925 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DbpQ60925 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms