Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms