Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms