Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms