Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc5a6Q5U4D8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms