Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr1Q5SWD9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms