Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc42Q5SV66 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms