Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms