Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap44Q5SSM3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms