Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bod1Q5SQY2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bod1Q5SQY2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bod1Q5SQY2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bod1Q5SQY2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bod1Q5SQY2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Bod1Q5SQY2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Bod1Q5SQY2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Bod1Q5SQY2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Bod1Q5SQY2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Bod1Q5SQY2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Bod1Q5SQY2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bod1Q5SQY2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms