Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms