Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scarf1Q5ND28 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms