Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Trappc1Q5NCF2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Trappc1Q5NCF2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Trappc1Q5NCF2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Trappc1Q5NCF2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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