Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms