Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms