Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tnni3kQ5GIG6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3kQ5GIG6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms