Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms