Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms