Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf2Q59J78 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms