Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Urb1Q571H0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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