Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn2bQ56A07 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms