Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig2Q52KR2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms